Sammanfattning

Chrysanthemum virus B encodes a multifunctional p12 protein that acts as a transcriptional activator in the nucleus and as a suppressor of RNA silencing in the cytoplasm. Here, we investigated the impact of p12 on accumulation of major classes of small RNAs (sRNAs). The results show dramatic changes in the sRNA profiles characterised by an overall reduction in sRNA accumulation, changes in the pattern of size distribution of canonical siRNAs and in the ratio between sense and antisense strands, lower abundance of siRNAs with a U residue at the 5 '-terminus, and changes in the expression of certain miRNAs, most of which were downregulated.

Publicerad i

Archives of Virology
2020, Volym: 165, nummer: 12, sidor: 2953-2959
Utgivare: SPRINGER WIEN

SLU författare

• Vetukuri, Ramesh

  • Institutionen för växtförädling, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Kalyandurg, Pruthvi Balachandra

  • Institutionen för växtbiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    
  • Institutionen för växtförädling, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Saripella, Ganapathi Varma

  • Institutionen för växtförädling, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Sen, Diya

  • Institutionen för växtskyddsbiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Gil, José Fernando

  • Institutionen för växtbiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Lukhovitskaya, Nina

  • Institutionen för växtbiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Grenville-Briggs Didymus, Laura

  • Institutionen för växtskyddsbiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Savenkov, Eugene

  • Institutionen för växtbiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

UKÄ forskningsämne

Mikrobiologi


Publikationens identifierare

DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-020-04832-y

Permanent länk till denna sida (URI)

https://res.slu.se/id/publ/108415