Sammanfattning

Treponema phagedenis' is considered to be a key agent in the pathogenesis of bovine digital dermatitis, an infectious foot condition of economic and animal welfare importance. We hereby report the draft sequence of 'T. phagedenis' strain V1. The draft genome assembly consists of 51 scaffolds comprising 3,129,551 bp and a GC-content of 39.9 %. Putative pathogenicity related factors have been identified in the genome that can be used in future studies to gain insight into the pathogenic mechanisms of 'T. phagedenis'.

Nyckelord

'T. phagedenis'; Genome assembly; Digital dermatitis; Vastra Gotaland; Sweden

Publicerad i

Standards in Genomic Sciences
2015, Volym: 10, artikelnummer: 67
Utgivare: BIOMED CENTRAL LTD

SLU författare

• Mustaq, Mamoona

  • Institutionen för husdjurens biovetenskaper, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Manzoor, Shahid

  • Institutionen för husdjurens biovetenskaper, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Rosander, Anna

  • Institutionen för husdjurens biovetenskaper, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Bongcam Rudloff, Erik

  • Institutionen för husdjurens biovetenskaper, Sveriges lantbruksuniversitet
    

UKÄ forskningsämne

Bioinformatik och systembiologi


Publikationens identifierare

DOI: https://doi.org/10.1186/s40793-015-0059-0

Permanent länk till denna sida (URI)

https://res.slu.se/id/publ/75490