Metabolome and transcriptome profiling reveal new insights into somatic embryo germination in Norway spruce (Picea abies)

Sammanfattning

Transcriptome, metabolome and histological profiling were performed on normal and aberrant somatic embryo germinants of Norway spruce (Picea abies L. Karst) providing a simplistic systems biology description of conifer germination. Aberrant germinants (AGs) formed periderm-like tissue at the apical pole and lacked shoot growth above the cotyledons. Transcriptome profiling (RNA-Sequencing) revealed a total of 370 differentially expressed genes at >= 1 or

Nyckelord

germination; histology; metabolite profiling; Norway spruce; RNA-Seq; somatic embryo

Publicerad i

Tree Physiology
2017, volym: 37, nummer: 12, sidor: 1752-1766

SLU författare

• Dobrowolska, Izabela

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    
  • Uniwersytet Śląski

• Businge, Edward

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Abreu, Ilka

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Moritz, Thomas

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Egertsdotter, Ulrika

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

UKÄ forskningsämne

Biokemi
Molekylärbiologi

Publikationens identifierare

• DOI: https://doi.org/10.1093/treephys/tpx078

Permanent länk till denna sida (URI)

https://res.slu.se/id/publ/86491